A Punção Aspirativa com Agulha Fina é realizada ao mesmo tempo que o ultrassom da tireoide. Quando se faz a PAAF retira-se pedacinhos do tecido que compõe o nódulo para que possa ser analisado no laboratório, e durante este exame a parte líquida também pode ser retirada para ser analisada e para diminuir o tamanho do nódulo.